После того как Годзилла атаковал Сан-Франциско, Кейт вновь оказывается в состоянии шока, узнав ошеломляющую тайну. Это открытие заставляет её отправиться в мировое путешествие с целью раскрыть истину...

В начале XVII века английский штурман Джон Блэкторн переживает кораблекрушение и оказывается на территории Японии, страны, закрытой для европейцев. Его жизнь висит на волоске, когда он становится...